1909-10
11日三井銀行倉庫部より「東神倉庫株式会社」として分離独立、本店を東京に、支店を東京、神戸、門司に設置1913年横浜派出開業（1923年横浜支店となる）
1917-08
神戸桟橋会社の海上業務を買収し、港湾運送事業に進出
1918-01
大阪倉庫会社を買収、大阪支店として営業を開始
1922-09
名古屋出張所設置（1937年名古屋支店となる）
1942-03
社名を「三井倉庫株式会社」と改称1944年戦時体制下に発足した「日本倉庫統制㈱」に各地の主要施設を供出1945年日本倉庫統制㈱から供出施設及び業務の返還を受け、各支店とも営業を再開
1948-07
大阪に「大正運輸㈱」設立（1967年現社名の「三井倉庫港運㈱」に改称）
1950-04
東京証券取引所に株式を上場
1950-08
福井に「是則倉庫運輸㈱」設立（1966年「福井三則倉庫運輸㈱」と改称、1992年現社名の「㈱ミツノリ」に改称）
1961-03
北海道釧路に「北海三井倉庫㈱」を設立（2012年「北海三井倉庫ロジスティクス㈱」に改称）
1966-08
自動車運送取扱業を開始
1968-03
海上コンテナの取扱いと国内におけるコンテナ・ターミナルの運営を開始
1969-04
貨物自動車運送業の免許取得、コンテナのトラック輸送開始
1977-12
本店に国際部、プラント部設置、国際運送業務を本格展開
1979-08
シンガポールに「Mitsui-Soko (Singapore) Pte. Ltd.」設立
1982-06
IATA航空貨物代理店資格取得、航空貨物取扱業務を本格化
1982-12
米国・ニューヨークに「Mitsui-Soko (U. S. A.) Inc.」設立
1984-11
本店所在地を「東京都中央区日本橋箱崎町」から「中央区日本橋茅場町一丁目」に移転
1986-11
ビッグバッグ業務（トランクルーム保管、引越等の非商品対象業務）を開始
1988-02
シンガポールに「MITSUI-SOKO INTERNATIONAL PTE LTD」設立
1989-03
「三井倉庫箱崎ビル」竣工（2024年「MSH日本橋箱崎ビル」に改称)、不動産賃貸業務を本格展開
1992-01
本支店制を廃止し、本支社制（本社各部及び関東、中部、関西、九州各支社）とする
2001-04
九州支社を「三井倉庫九州㈱」として分社
2002-06
本店所在地を「東京都中央区日本橋茅場町一丁目」から「東京都港区海岸三丁目」に移転
2004-04
執行役員制度導入
2006-04
本社にBPO事業推進部を設置、BPO（ビジネス・プロセス・アウトソーシング）事業を本格展開
2008-04
本社に3PL推進部を設置、3PL（サード・パーティ・ロジスティクス）事業を本格展開
2009-10
創立100周年を迎える
2009-12
自己株式1,500万株を消却（発行済株式総数を124,415,013株に減少）
2010-04
全社組織を改編し、事業部門制度を導入
2011-03
ジェイティービーエアカーゴ㈱の全株式を取得し、㈱三井倉庫エアカーゴに改称
2011-09
本店所在地を「東京都港区海岸三丁目」から「東京都港区西新橋三丁目」に移転
2011-12
中国におけるｅコマースビジネスのための物流、商流インフラを構築、提供開始
2012-03
中国に「三井倉庫（中国）投資有限公司」を設立
2012-04
三洋電機ロジスティクス㈱の全株式を取得し、三井倉庫ロジスティクス㈱に改称
2012-07
㈱三井倉庫エアカーゴとＴＡＳエクスプレス㈱を合併し、三井倉庫エクスプレス㈱に改称
2014-10
持株会社制への移行に伴い、社名を「三井倉庫ホールディングス株式会社」と改称し、倉庫事業部門・港湾運送事業部門を「三井倉庫㈱」、及びBPO事業部門を「三井倉庫ビジネストラスト㈱」として分社化
2015-04
ソニーサプライチェーンソリューション㈱の株式を66％取得し、三井倉庫サプライチェーンソリューション㈱に改称
2015-11
三井倉庫トランスポート㈱設立
2015-12
三井倉庫トランスポート㈱が大阪に本社を置く丸協運輸㈱及び愛媛に本社を置く丸協運輸㈱並びにその他関係する会社4社の全株式を取得し、連結子会社化
2017-04
三井倉庫ビジネストラスト㈱を吸収合併により三井倉庫㈱へ統合
2018-10
普通株式を5対1の割合で併合し、単元株式を100株に変更
2025-05
普通株式を1対3の割合で分割
2025-05
本店所在地を「東京都港区西新橋三丁目」から「東京都中央区日本橋箱崎町」に移転
2026-02
三井不動産㈱と資本業務提携契約を締結
