2005-08
微細藻類ユーグレナの研究開発、製造、販売を目的として、東京都港区六本木に株式会社ユーグレナを設立
2005-12
ユーグレナの食品用途屋外大量培養に成功
2006-02
食品の自社製品販売を開始し、ヘルスケア事業（食品）に参入
2006-10
食品のOEM製品の販売を開始
2007-04
本店所在地を東京都文京区本郷「東京大学アントレプレナープラザ」に移転、研究所を設置
2008-12
化粧品のOEM製品の販売を開始し、ヘルスケア事業（化粧品）に参入
2011-11
株式取得により、八重山殖産株式会社を関連会社化
2012-04
食品を中心としたブランド「ユーグレナ・ファーム」のインターネット販売を開始
2012-10
沖縄県石垣市白保に生産技術研究所を設置
2012-12
東京証券取引所マザーズに上場
2013-03
八重山殖産株式会社の株式取得（現・連結子会社）
2013-10
バングラデシュ人民共和国ダッカに事務所を開設
2014-04
本店を東京都文京区後楽に移転し、中央研究所を神奈川県横浜市鶴見区に移転
2014-12
東京証券取引所市場第一部に上場
2015-03
本店所在地を東京都港区芝に移転
2015-03
Grameen euglena（バングラデシュ人民共和国ダッカ市、旧社名Grameen Yukiguni Maitake.Ltd）の株式取得（現・連結子会社）
2015-09
株式会社エポラの株式取得（現・連結子会社）
2015-09
ユーグレナ竹富エビ養殖株式会社（旧社名竹富エビ養殖株式会社）の株式取得（現・連結子会社）
2017-10
株式会社ジーンクエストの株式取得（現・連結子会社）
2018-10
神奈川県横浜市鶴見区でバイオジェット・ディーゼル燃料製造実証プラント竣工（
2024-01
に稼働終了）
2019-06
株式会社MEJの株式取得（現・連結子会社）
2020-08
創業15周年を機にCIを刷新、ユーグレナ・フィロソフィー「Sustainability First」を制定
2021-05
キューサイ株式会社の連結子会社化
2021-06
国土交通省が保有する飛行検査機にて、当社バイオジェット燃料による初フライト成功
2021-08
定款上の事業目的についてSDGsを反映したものに全面改訂
2021-12
大協肥糧株式会社の株式取得（現・連結子会社）
2022-03
マレーシア国クアラルンプール市にEuglena Malaysia Sdn.Bhd.を設立（現・連結子会社）
2022-04
東京証券取引所プライム市場への市場区分変更
2024-02
株式会社サティス製薬、日本ビューテック株式会社の株式取得（現・連結子会社）
2024-04
英国領ケイマン諸島にEuglena Sustainable Investment Limitedを設立（現・連結子会社）
2024-12
マレーシア国でバイオ燃料製造プラントを建設・運営する合弁会社Pengerang Biorefinery Sdn. Bhd.に、Euglena Sustainable Investment Limitedを通じて出資（出資比率5％）
2025-06
アグリ領域初の自社ブランド「いきものたちにユーグレナ」が誕生
2025-07
Pengerang Biorefinery Sdn. Bhd.への出資比率を15％に引き上げ
