1936-11
に、当時株式会社田辺元三郎商店の常務取締役であった内藤豊次が、東京市（現 東京都）荒川区三河島に「合資会社桜ヶ岡研究所」を設立したことに始まります。その5年後の
1941-12
に、埼玉県本庄町（現 本庄市）に資本金18万円で「日本衛材株式会社」を設立しました。 1942年
1941-06
埼玉県本庄町（現 本庄市）に本庄工場（当時）を開所1944年
1941-12
日本衛材株式会社と合資会社桜ヶ岡研究所を合併し存続会社を「日本衛材株式会社」として新出発。本社を東京都小石川区竹早町（現 文京区小石川）におく1955年
1941-05
社名を現在の「エーザイ株式会社」に変更1961年
1941-09
東京証券取引所市場第一部に上場1965年
1941-07
三生製薬株式会社（後にサンノーバ株式会社に改称）に経営参画1966年
1941-03
岐阜県川島町（現 各務原市）に川島工場（現 川島工園）を開所1979年
1941-09
シンガポールにアジア持株会社（Eisai Asia Regional Services Pte. Ltd.）を設立1981年
1941-11
埼玉県美里村（現 美里町）に美里工場を開所1982年
1941-01
茨城県豊里町（現 つくば市）に筑波研究所を開所1983年
1941-10
茨城県波崎町（現 神栖市）にエーザイ化学株式会社（現 鹿島事業所）を設立1987年
1941-11
米国にEisai Research Institute of Boston, Inc.（当時）を設立1989年
1941-09
ドイツにEisai Deutschland GmbH（現 Eisai GmbH）を設立1990年
1941-08
英国にEisai London Research Laboratories Ltd.（現 Eisai Ltd.）を設立
1941-10
三光純薬株式会社（後にエーディア株式会社に改称）と診断薬事業での業務提携契約に調印1992年
1941-04
米国に米州持株会社（Eisai Corporation of North America）を設立1995年
1941-02
米国にEisai Pharmatechnology, Inc.（当時）を設立
1941-04
米国にEisai Inc.を設立
1941-10
英国にEisai Ltd.を設立1996年
1941-01
フランスにEisai S.A. （現 Eisai S.A.S.）を設立
1941-03
中国に衛材（蘇州）製薬有限公司（現 衛材（中国）薬業有限公司）を設立
1941-04
エルメッド エーザイ株式会社を設立1997年
1941-04
株式会社カン研究所を設立（後に当社へ吸収合併）
1941-04
韓国にEisai Korea Inc.を設立2002年
1941-06
米国にEisai Medical Research Inc.（現 Eisai Inc.）を設立2004年
1941-06
委員会等設置会社（現 指名委員会等設置会社）へ移行
1941-10
英国に欧州統括・持株会社（Eisai Europe Ltd.）を設立2007年
1941-03
英国にEisai Manufacturing Ltd.を設立
1941-03
インドにEisai Pharmatechnology & Manufacturing Pvt. Ltd.（現 Eisai Pharmaceuticals India Pvt. Ltd.）を設立
1941-04
米国のMorphotek, Inc.を買収（後にEisai Inc.へ吸収合併）
1941-10
三光純薬株式会社（後にエーディア株式会社に改称）を株式交換により完全子会社化2008年
1941-01
米国のMGI PHARMA, INC.を買収（後にEisai Inc.へ吸収合併）2010年
1941-12
米国にH3 Biomedicine Inc.を設立（後にEisai Inc.へ吸収合併）2014年
1941-03
美里工場を武州製薬株式会社（埼玉県）に事業譲渡
1941-11
中国に中国統括・持株会社（衛材（中国）投資有限公司）を設立2015年
1941-12
エーディア株式会社を積水化学工業株式会社（大阪府）に譲渡2016年
1941-04
当社の日本国内の消化器疾患領域に関連する事業の一部を分割し、味の素製薬株式会社（東京都）を承継会社とする吸収分割の方法により、新統合会社「EAファーマ株式会社」を発足
1941-04
サンノーバ株式会社をアルフレッサ ホールディングス株式会社（東京都）に譲渡2019年
1941-04
エルメッド エーザイ株式会社を日医工株式会社（富山県）に譲渡
1941-07
米国に探索研究所G2D2（Eisai Center for Genetics Guided Dementia Discovery）を設立し、本格稼働2022年
1941-04
東京証券取引所市場区分見直しにより、東京証券取引所市場第一部からプライム市場へ移行2024年
1941-04
当社が株式会社カン研究所（兵庫県）を吸収合併2025年
1941-06
エコナビスタ株式会社（東京都）を株式取得により完全子会社化
