1969-08
札幌市北区において受託臨床検査を目的として資本金130万円にて株式会社第一臨床検査センターを設立。
1981-11
北海道旭川市に設立された株式会社第一臨床検査センターに資本参加。
1988-03
株式会社第一臨床検査センター（旭川市）を吸収合併。
1988-10
本社を札幌市東区に移転。
1989-05
株式会社オータニを吸収合併し、ドラッグストアを承継。臨床検査事業を診断事業部、販売事業をリテール事業部（のちの物販事業部、現 リテール事業）とする事業部制を採用。
1993-05
北海道旭川市に「第一薬局」（現 アイン薬局豊岡店）を開局し、薬局事業に参入。
1994-03
日本証券業協会に株式を店頭登録。
1994-05
薬局名称を「アイン薬局」に統一。
1994-06
東京都新宿区に子会社の株式会社アインメディカルシステムズ（現 株式会社アインファーマシーズ）を設立。
1995-05
薬局事業を物販事業部（現 リテール事業）から分離し、医薬事業部（現 ファーマシー事業）を新設。
1996-10
ドラッグストア店舗名称を「アインズ」に統一。
1998-10
臨床検査事業の全部を株式会社第一臨床検査センター札幌ラボラトリーに営業譲渡。
1998-11
株式会社アインファーマシーズに商号を変更。
1999-02
丸紅株式会社と株式会社アインメディカルシステムズ（現 株式会社アインファーマシーズ）との三者間で、薬局事業に関する業務提携及び資本提携契約を締結。
2002-10
株式会社アインメディカルシステムズ（現 株式会社アインファーマシーズ）が日本証券業協会に株式を上場。札幌市中央区に新業態のコスメ&ドラッグストア「アインズ&トルペ地下街店」を出店。
2004-01
コスメ&ドラッグストア業態への事業集約のため、関東地区のドラッグストアを営業譲渡。
2004-09
医療に関するコンサルティング及び情報誌を販売する株式会社メディウェルを子会社化（
2007-04
期より連結子会社）。
2006-04
株式会社ホールセールスターズ（連結子会社）を設立し、ジェネリック医薬品の卸売業を開始。
2007-01
株式会社ダイチク（現 株式会社アイン北陸）を子会社化。
2007-06
株式会社あさひ調剤（現 株式会社アイン中央）を子会社化。
2008-06
株式会社アインメディカルシステムズ（現 株式会社アインファーマシーズ）との株式交換により、同社を完全子会社。
2008-08
株式会社セブン&アイ・ホールディングスと業務提携及び資本提携契約を締結。
2009-04
東京証券取引所市場第二部に株式を上場。
2009-06
株式会社セブン&アイ・ホールディングス、株式会社イトーヨーカ堂及び株式会社セブン-イレブン・ジャパンと共同出資により、ドラッグストア運営会社「株式会社セブンヘルスケア」を設立。
2010-04
東京証券取引所市場第一部指定。
2010-05
札幌証券取引所に株式を上場。
2013-11
本社を札幌市白石区に移転。
2015-09
株式会社アユーララボラトリーズを子会社化。
2015-11
持株会社体制への移行に伴い、商号を株式会社アインホールディングスに変更し、事業部門に関する権利義務を連結子会社である株式会社アインファーマシーズに承継。
2020-03
シダックス株式会社と業務提携契約を締結、同社子会社シダックスアイ株式会社（現 株式会社アインファーマシーズ）を子会社化。
2022-04
東京証券取引所の市場区分見直しにより、市場一部からプライム市場へ移行。
2022-05
株式会社ファーマシィホールディングス（現 株式会社ファーマシィ）を子会社化。
2024-08
株式会社Francfrancを子会社化。
2025-04
株式会社エーアンドエムを子会社化。
